Chordopoxvirinae

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Chordopoxvirinae

Humane Pockenviren (TEM-Abbildung)

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Varidnaviria[1]
Reich: Bamfordvirae[1]
Phylum: Nucleocytoviricota[1]
Klasse: Pokkesviricetes[1]
Ordnung: Chitovirales[1]
Familie: Poxviridae
Unterfamilie: Chordopoxvirinae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: komplex
Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Chordopoxvirinae
Kurzbezeichnung
ChPV
Links
NCBI Taxonomy: 10241
ViralZone (Expasy, SIB): 172
ICTV Taxon History: 201904738

Die Unterfamilie Chordopoxvirinae fasst acht Gattungen der Familie Poxviridae zusammen, die bei Wirbeltieren (Vertebraten), beispielsweise Säugetieren, Vögeln und Nagetieren, Infektionen verursachen können. Die Unterfamilie wurde geschaffen, um diese Gattungen von den Mitgliedern der Unterfamilie Entomopoxvirinae zu separieren, die nur Pockenviren bei Insekten umfassen. Aufgrund dieser Abtrennung wurde der Name der Gattung nicht nach den Wirbeltieren „Vertebropoxvirinae“ benannt, sondern nach dem Stamm der Chordatiere, obwohl noch keine Pockenviren bei nicht zu den Wirbeltieren gehörenden Chordatieren isoliert wurden. Diese Einteilung nach dem Wirtsspektrum spiegelt sich auch in der phylogenetischen Distanz zwischen Chordo- und Entomopoxvirinae wider.

Zwischen den Gattungen der Chordopoxvirinae wird eine serologische Kreuzreaktivität beobachtet, wobei die Mitglieder der Avipoxviren bei Vögeln diese Eigenschaft weniger aufweisen als die Viren bei Säugetieren. Einige Mitglieder der Chordopoxvirinae verursachen typische Läsionen auf der Chorioallantoismembran, wenn sie in embryonierten Hühnereiern für Laborzwecke angezüchtet werden.

Aufbau und Genom[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die Mitglieder der Chordopoxvirinae stellen sich als ovoide oder Backstein-förmige Virionen dar.

Das lineare, doppelsträngige DNA-Genom besitzt gewöhnlich einen niedrigen GC-Gehalt von 30 bis 40 %, kann aber von 25 bis 67 % variieren. Ein hoher GC-Gehalt liegt bei den Gattungen Parapoxvirus und Crocodylidpoxvirus sowie dem Molluscum-contagiosum-Virus vor.[2][3][4]

Das Genom von Molluscum contagiosum virus Subtyp 1 hat einen GC-Gehalt von 63,4 %, das der Parapoxviren Bovine papular stomatitis virus (Strain BV-AR02) und Orf virus (Strain OV-SA00) hat 64,5 % respektive 64,3 %.[4] Das Genom des Nile crocodilepox virus hat eine Länge von 190.054 Basenpaaren (bp). Es kodiert vorhergesagt für 173 Proteine bei einem GC-Gehalt von 61,9 % (Strain Simbabwe).[5][4]

Eine stets gleichförmig angeordnete Gruppe von zentralen Genen charakterisiert die Chordopoxvirinae trotz variabler Sequenzen zwischen den Gattungen.

Systematik[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

Die innere Systematik der Chordopoxvirinae ist nach ICTV, Stand 30. April 2024, wie folgt:[6][7]

  • Unterfamilie Chordopoxvirinae
  • Gattung Avipoxvirus (Vogelpockenviren),
    • ehem. Typus: Avipoxvirus fowlpox (früher Avipoxvirus galli), mit Fowlpox virus
  • Gattung Capripoxvirus (Schaf- und Ziegenpockenviren),
    • ehem. Typus: Capripoxvirus sheeppox (früher Capripoxvirus ovis), mit Sheeppox virus
    • Capripoxvirus goatpox (früher Capripoxvirus caprae), mit Goatpox virus
    • Capripoxvirus lumpyskinpox (früher Capripoxvirus bovis nodularis) mit Dermatitis-nodularis-Virus
  • Gattung Centapoxvirus,
    • einzige Spezies: Centapoxvirus yokapox mit Yokapox virus (YOKV)
  • Gattung Cervidpoxvirus,
    • einzige Spezies: Cervidpoxvirus muledeerpox mit Mule deerpox virus alias Deerpox-Virus (MDPV)[8]
  • Gattung Crocodylidpoxvirus (Krokodilpockenviren),
    • einzige Spezies: Crocodylidpoxvirus nilecrocodilepox mit Nile crocodilepox virus (Nilkrokodilpockenvirus, CRV)
  • Gattung Leporipoxvirus (Hasenpockenviren),[9]
    • ehem. Typus: Leporipoxvirus myxoma (früher Leporipoxvirus myxomatosis) mit Myxoma virus (Myxomatosevirus, MYXV) → Myxomatose;
    • Spezies Leporipoxvirus shope (früher Leporipoxvirus fibromatosis) mit Rabbit fibroma virus (Kaninchenfibromvirus, RFV)
    • Spezies Leporipoxvirus squirrelfibroma mit Squirrel fibroma virus (Hörnchenfibromvirus, SFV)
    • Spezies „Hare fibroma virus“[10] (Hasenfibromvirus, FIBV)
  • Gattung Macropopoxvirus (Kängurupockenvirus),
    • Spezies Macropopoxvirus mfuliginosuspox mit Western kangaroopox virus
    • Spezies Macropopoxvirus mgiganteuspox mit Eastern kangaroopox virus
  • Gattung Molluscipoxvirus (Weichtierpockenviren),
  • Gattung Mustelpoxvirus,
    • einzige Spezies: Mustelpoxvirus seaotterpox mit Sea otterpox virus
  • Gattung Orthopoxvirus (Echte Pockenviren),
  • Gattung Oryzopoxvirus,
    • einzige Spezies: Oryzopoxvirus cotia mit Cotia virus
  • Gattung Parapoxvirus (Parapockenviren),
  • Gattung Pteropopoxvirus,
    • einzige Spezies: Pteropopoxvirus pteropox mit Pteropox virus[11][12]
  • Gattung Salmonpoxvirus,
    • einzige Spezies: Salmonpoxvirus gillpox mit Salmon gillpox virus
  • Gattung Sciuripoxvirus,
    • einzige Spezies: Sciuripoxvirus squirrelpox (veraltet Squirrel parapoxviruss) mit Squirrelpox virus alias Berlin Squirrelpox virus (Berliner Eichhörnchen-Pockenvirus, BerSQPV), nicht näher verwandt mit dem „Britischen Eichhönchen-Pockenvirus“, „UK SPQV“[13][14]
  • Gattung Suipoxvirus (Schweinepockenviren),[15]
    • einzige Spezies: Suipoxvirus swinepox (früher Suipoxvirus suis) mit Swinepox virus (Schweinepockenvirus, SWPV)
  • Gattung Vespertilionpoxvirus,
    • einzige Spezies: Vespertilionpoxvirus eptesipox mit Eptesipox virus[16]
  • Gattung Yatapoxvirus (Yatapockenviren),[17]
    • ehem. Typus: Yatapoxvirus yabapox mit Yaba monkey tumor virus (Yaba-Affentumor-Virus, YMTV)
    • Spezies: Yatapoxvirus tanapox mit Tanapox virus (Tanapockenvirus), inkl. Yaba-like disease virus (YLDV)

Quellen[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  • R. M. Buller et al.: Subfamily Chordavirinae. In: C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London, San Diego, 2005, S. 122 ISBN 0-12-249951-4
  • B. Moss: Poxviridae: The Viruses and Their Replication. In: David M. Knipe, Peter M. Howley (eds.-in-chief): Fields’ Virology. 5. Auflage, Band 2, Philadelphia 2007, S. 2906ff ISBN 0-7817-6060-7

Einzelnachweise[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

  1. ↑ a b c d e ICTV: ICTV Taxonomy history: Variola virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ Eneida L. Hatcher, Chunlin Wang, Elliot J. Lefkowitz: Genome Variability and Gene Content in Chordopoxviruses: Dependence on Microsatellites. In: Viruses, Band 7, Nr. 4, 2015, S. 2126–2146; doi:10.3390/v7042126 (englisch).
  3. ↑ S. Roychoudhury, A. Pan, D. Mukherjee: Genus specific evolution of codon usage and nucleotide compositional traits of poxviruses. In: Virus Genes. 42. Jahrgang, Nr. 2, 2011, S. 189–199, doi:10.1007/s11262-010-0568-2, PMID 21369827 (englisch).
  4. ↑ a b c Yu Li, Hermann Meyer, Hui Zhao, Inger K. Damon: GC Content-Based Pan-Pox Universal PCR Assays for Poxvirus Detection. In: J Clin Microbiol., Band 48, Nr. 1, Januar 2010, S. 268–276; doi:10.1128/JCM.01697-09, PMC 2812294 (freier Volltext), Epub 11. November 2009 (englisch).
  5. ↑ David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators (Memento des Originals vom 26. September 2019 im Internet Archive)  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.pnas.org, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, hier: Supplement 1 (xlsx)@1@2Vorlage:Toter Link/www.pnas.org (Seite nicht mehr abrufbar, festgestellt im Oktober 2022. Suche in Webarchiven)  Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
  6. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  7. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  8. ↑ C. L. Afonso, G. Delhon, E. R. Tulman, Z. Lu, A. Zsak, V. M. Becerra, L. Zsak, G. F. Kutish, D. L. Rock: Genome of Deerpox Virus. In: J Virol., Band 79, Nr. 2, Januar 2005, S. 966–977; doi:10.1128/JVI.79.2.966-977.2005, PMC 538591 (freier Volltext), PMID 15613325 (englisch).
  9. ↑ SIB: Leporipoxvirus, auf: ViralZone.
  10. ↑ Peter J. Kerr, June Liu, Isabella Cattadori, Elodie Ghedin, Andrew F. Read, Edward C. Holmes: Myxoma Virus and the Leporipoxviruses: An Evolutionary Paradigm. In: MDPI - Viruses, Band 7, Nr. 3, 7. März 2015, S. 1020–1061; doi:10.3390/v7031020, PMID 25757062, PMC 4379559 (freier Volltext), Epub 6. März 2015 (englisch).
  11. ↑ Chris Upton, Ginny Emerson, Mark A O’Dea: ICTV Proposal 2016.013aD (PDF; 634 kB).
  12. ↑ Red squirrels in Bangor, North Wales on the increase, auf: SquirrelWeb vom 23. Juli 2018.
  13. ↑ G. Wibbelt, S. H. Tausch, P. W. Dabrowski, O. Kershaw, A. Nitsche, L Schrick: Berlin squirrelpox virus, a new poxvirus in red squirrels, Berlin, Germany. In: Emerg Infect Dis. Vol. 23, Nr. 10, Oktober 2017, doi:10.3201/eid2310.171008 (englisch).
  14. ↑ Claudia Romeo: Parasites And Biological Invasions: Alien Grey Squirrel (Sciurus carolinensis) And Native Red Squirrel (S. vulgaris) As Model System. (PDF; 1,7 MB) Università degli studi di Milano, dipartimento di bioscienze, WS 2012/2013.
  15. ↑ SIB: Suipoxvirus, auf: ViralZone
  16. ↑ Shin-Lin Tu, Yoshinori Nakazawa, Jinxin Gao, Kimberly Wilkins, Nadia Gallardo-Romero, Yu Li, Ginny L. Emerson, darin S. Carroll, Chris Upton: Characterization of Eptesipoxvirus, a novel poxvirus from a microchiropteran bat. In: Virus Genes, Dezember 2017, Band 53, Issue 6, S. 856–867; doi:10.1007/s11262-017-1485-4 (englisch).
  17. ↑ SIB: Yatapoxvirus, auf: ViralZone

Weblinks[Bearbeiten | Quelltext bearbeiten]

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